O Fundo Amazônia apoia, com recursos não reembolsáveis, ações de prevenção, monitoramento e combate ao desmatamento. Promove ainda ações que buscam a conservação e o uso sustentável da floresta na Amazônia Legal, além de poder utilizar até 20% de seus recursos no apoio ao desenvolvimento de sistemas de monitoramento e de controle do desmatamento em outros biomas brasileiros e em outros países com florestas tropicais.

Em oito anos de existência, o Fundo Amazônia apoiou 86 projetos, dos quais 12 já foram concluídos, e contou com 48 doações, que totalizam mais de R$ 2,8 bilhões. Seus doadores são os governos da Noruega (responsável por 97,4% das doações captadas) e da Alemanha (que, por meio do KfW Entwicklungsbank, responde por 2,1% das doações) e a Petrobras (com 0,5% das doações).

A gestão do fundo – isto é, a captação e a aplicação de recursos, o acompanhamento e o monitoramento de suas ações e projetos apoiados, a prestação de contas e a comunicação dos resultados obtidos, além da secretaria executiva do Comitê Orientador do Fundo Amazônia – é feita pelo BNDES.